通过检查找到病因后，根据不同的情况，制定出有针对性的治疗方案。如输卵管不通畅的女性，可以在服用药物的同时，配合一些必要的措施保守治疗，或采用腹腔镜对卵输管施整形术；对于内分泌失调、月经不规律或继发性闭经的女性要首先调整内分泌水平；而对于那些有排卵障碍的女性，可使用药物来促排卵，并在B超监测下，观察卵泡的发育；对于有生殖免疫因素的患者可用药物来治疗，以达到抑制或消除抗体的作用。
对于精液质量欠佳的男性如：精子数量较少、成活率偏低、活力较弱、液化不良等症状，可用药物及一些方法来治疗，以提高精子质量，而达到能够受孕的水平。
经过系统的基础治疗及调整，使夫妇双方的状态达到受孕的最佳水平。有不少夫妇在此阶段便已怀孕，如未能受孕，则进入下一步，即助孕阶段。