慢性附睾炎较多见，部分病人因急性期未能彻底治愈而转为慢性，但多数病人并无明确的急性期，炎症多继发于慢性前列腺炎或损伤。
病人常感患侧阴囊隐痛、胀坠感，疼痛常牵扯到下腹部及同侧腹股沟，有时可合并有继发性的鞘膜积液。检查时附睾常有不同程度的增大变硬，有轻度压痛，同侧输精管可增粗。
慢性附睾丸炎由于纤维增生使整个附睾硬化，显微镜下疤痕非常显著，常可看到附睾管闭塞，组织被淋巴细胞和浆细胞浸润。
慢性附睾丸炎通常无症状，除非有急性发作的情况，此时可出现局部不适，病人可触及阴囊内有一肿块，附睾增厚并增大，有或无压痛，触诊极易将附睾与睾丸区分开，精索往往增粗，有时输精管直径增大，前列腺变硬并有纤维化，前列腺液常可见脓细胞，尿液分析可显示继发于前列腺炎的感染。