严重急性附睾炎不可逆的终末期即为慢性附睾炎，此时可经常出现较急性附睾炎症状轻的表现。慢性附睾炎由于纤维增生使整个附睾硬化，显微镜下疤痕非常显著，常可看到附睾管闭塞，组织被淋巴细胞和浆细胞浸润。
慢性附睾炎通常无症状，除非有急性发作的情况，此时可出现局部不适，病人可触及阴囊内有一肿块，附睾增厚并增大，有或无压痛，触诊极易将附睾与睾丸区分开，精索往往增粗，有时输精管直径增大，前列腺变硬并有纤维化，前列腺液常可见脓细胞，尿液分析可显示继发于前列腺炎的感染。