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近年来，科学家们发现一些呼吸疾病与男性不育症有一定的关系，其中以纤毛不动综合征，Young氏综合征及囊性纤维化关系最为密切。
纤毛不动综合征是1975年由Pederson及Afzelius分别观察到的。有些男性不育的精子虽存活但不能运动，而精子不能运动的原因是由于精子鞭毛中轴丝的结构异常造成的。在之后 ，人们发现精子轴丝异常者同时合并呼吸道等部位的纤毛运动障碍，表现为呼吸道阻塞性疾病、感染等征象。由于轴丝既是精子鞭毛的核心结构，又是纤毛的核心结构，所以Eliasson将这一系列征象统称为纤毛不动综合征。纤毛不动综合征在近亲婚配的地区发病率较高，多有慢性肺部炎症、慢性鼻炎及鼻息肉、慢性或复发性上颌窦炎及筛窦炎的病史，约50%的患者有内脏转位现象，患者的第二性征及性器官发育正常，精液量及精子数量在正常范围，精液染色显示精子是存活的，但不能运动或很少运动，超微结构检查可见轴丝的病理改变。
Young氏综合征也是与慢性呼吸道感染有关的男性不育，以反复发作的鼻窦炎及肺部感染，合并双侧附睾渐进性梗阻所致的无精子症为特征。其在男性不育中约占3.3%，在男性梗阻性不育中约占21%～67%，多数报告认为占50%左右。Young氏综合征的病理改变之一位于附睾，表现为双侧附睾头增大或呈囊性，多局限于附睾头近端1～1.5cm，体尾部及输精管无异常。该病的临床特征是在幼年期即出现反复咳嗽、多痰，许多人在幼年期就确诊为支气管炎，约62%的病人表现为慢性鼻窦炎，成年后呼吸道感染症状会好转，发作时应用抗生素及对症治疗后便可缓解，日常活动及体力活动并不受限制。胸部X线片可在 41%的患者中发现慢性感染的征象。体检时可见患者生长发育正常，第二性征及性功能也正常 ，触诊双侧附睾头增大或呈囊性感，无变硬及压痛，生殖系统其他部位正常，精液检查无精子，血中性激素测定FSH、LH及睾丸酮均正常，睾丸活检及精道造影无异常，只是在附睾部位可以发现病变。
囊性纤维化是遗传性疾病，主要发生在白种人，北欧及美国发病率较高，亚洲人则较少。在新生儿中的发病率为1∶1500～1∶2000，死亡率较高。主要表现为外分泌腺功能紊乱，粘液腺增生，分泌液粘稠，引起呼吸道等器官被分泌物阻塞的表现，同时造成生殖道异常，导致男性不育。
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