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试管婴儿常引起多个卵泡发育，最终导致多个胚胎，但又不可能同时移植所有的胚胎，故剩余的胚胎就有必要用冷冻技术储存，如果多本次移植失败，患者不再需要进行需要进行超排卵治疗，可实施冷冻胚胎移植。冷冻的温度在零下(-196度)，胚胎一旦被冷冻储存，则停止发育，可保存几年以上。
目前的冷冻胚胎技术，解冻后，胚胎的存活率为60-70%，妊娠率为30%，该技术的优点之一是能在自然月经周期解冻胚胎后移植，不需要使用促排卵药物，节省费用，且使子宫内膜的接受性有所改善，故容易种植。同时，因为种植的胚胎数较少，多胎妊娠的机会下降。
在胚胎的冷冻过程中，如患有多余的胚胎有较多的碎片，医生一般不会将气冷藏。因为这类胚胎经冷冻复苏的双重打击后，胚胎质量会进一步下降，成功率很低。在一般的胚胎解冻后，若胚胎因不耐冻或其他原因使胚胎产生较多碎片，这种胚胎植入子宫后的成功率很低，一般医生会与患者讨论是否放弃移植。
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